Die Koordinierungsstelle des Innovationsverbundes ist am Zentrum Technik und Gesellschaft an der TU Berlin angesiedelt. Sie organisiert die Aktivitäten des Verbundes wie Workshop-, Vortragsreihen und Netzwerktreffen und eine jährliche Tagung zur Ostdeutschlandforschung. Sie unterstützt neue Forschungsvorhaben und Publikationen und koordiniert die Zusammenarbeit der Institute.